許多天然產(chǎn)物和藥物都含有柔性烷基鏈。這些分子由長長的碳鏈組成,它們通常非常柔性。對于這類樣品,傳統(tǒng)的晶體海綿法可以將它們絡合進入金屬有機框架(MOF)的孔道中,然后用單晶X射線衍射分析對其進行結(jié)構(gòu)測定。然而,傳統(tǒng)的晶體海綿樣品制備過程繁瑣,對目標分子缺乏選擇性識別能力,解析精度存在一定問題。長烷基鏈分子被晶體海綿絡合后會產(chǎn)生十分無序的結(jié)構(gòu),使得確定它們的單晶結(jié)構(gòu)十分困難。
國家蛋白質(zhì)科學研究(上海)設施用戶浙江大學黃飛鶴教授及其合作團隊,引入了一種變革性方法,利用柱[5]芳烴摻雜的MOF材料進行超分子對接,并對此前難以處理的含烷基鏈分子進行結(jié)構(gòu)分析。該方法實驗操作簡單,測試所需時間短,適用底物范圍廣,在天然產(chǎn)物、藥物和有機合成中間體的結(jié)構(gòu)確定方面都具有非常廣闊的應用前景。此外,這項研究將深刻影響多個科學領域的結(jié)構(gòu)測定,標志著晶體學方法和化學分析技術的重大進步。
國家蛋白質(zhì)科學研究(上海)設施BL17B1線站為此項研究中的單晶X射線衍射(SC-XRD)表征提供了研究機時和實驗支持。研究成果以“Supramolecular docking structure determination of alkyl-bearing molecules”為題發(fā)表于《自然》(Nature)雜志上。
